A lo largo de estos años hemos vivido procesos de organización interna para adecuarnos a las exigencias de cada momento. En camino a su quinta década de servicio a los obispos peruanos, junto a las comunidades cristianas de todo el país, y a la sociedad en general, CEAS cuenta con dos áreas:

La "Pastoral de los Derechos Humanos, Construcción de Paz y Justicia Penal y Penitenciaria" y la "Pastoral del Cuidado de los Bienes de la Creación, Economía Solidaria y Democracia Participativa" que albergan programas específicos que comparten este gran objetivo de defender y promover los derechos humanos universales, indivisibles, inalienables e inviolables de todas las personas sin excepción.